Толық геномды секвенирлеу үшін қой құлақ ойықтарынан ДНҚ алу әдістерінің тиімділігін бағалау
##plugins.pubIds.doi.readerDisplayName##:
https://doi.org/10.51452/cajvs.2026.3(015).2248Ключевые слова:
Толық геномды секвенирлеу, ДНҚ алу, қой құлақ үлгісі, STAB, PureLink геномдық ДНҚ жинағы, Қазақтың құйрықты қойларыАннотация
Кіріспе және мақсат. Толық геномды секвенирлеу (WGS) - мал популяциясының генетикалық құрылымын зерттеудің қуатты құралы. WGS тиімділігі көбінесе бастапқы геномдық ДНҚ сапасымен анықталады. Далалық жағдайда алынған қой құлақ белгілері биоматериалдың ыңғайлы көзі болып табылады; дегенмен, олардағы дәнекер тіннің жоғары тығыздығы ДНҚ алуды қиындатады. Бұл зерттеудің мақсаты STAB әдісі мен қазақтың ірі жүнді майлы құйрықты қойларының құлақ белгілерінен ДНҚ алу үшін коммерциялық PureLink геномдық ДНҚ жинағын салыстыру болды.
Материалдар мен әдістер. Зерттеу екі кезеңде жүргізілді. Бірінші кезеңде STAB лизис буфері, ал екінші кезеңде коммерциялық PureLink геномдық ДНҚ жинағы (Thermo Fisher Scientific) қолданылды. Сапаны бақылау NanoDrop2000 спектрофотометрі және гель электрофорезі арқылы жүргізілді.
Нәтижелері. CTAB арқылы бөлініп алынған ДНҚ-ның орташа концентрациясы 293 нг/мкл құрады, ал A260/280 қатынасы 1,70-тен 1,86-ға дейін болды (орташа 1,78 ± 0,04), бұл гетерогенді тазалықты көрсетеді. PureLink жинағы үнемі жоғары сапаны көрсетті: концентрациясы 350,2 ± 96,9 нг/мкл, A260/280 1,86 ± 0,01 және A260/230 2,13 ± 0,08.
Қорытынды. Коммерциялық PureLink геномдық ДНҚ жинағы қой құлағынан ДНҚ алу үшін ұсынылады, себебі ол толық геномды секвенирлеу талаптарына сәйкес келетін тұрақты сандық және сапалық деректерді береді.
