Оптимизация протокола ПЦР-диагностики вироида веретеновидности клубней картофеля (Рotato spindle tuber viroid, PSTVd)
##plugins.pubIds.doi.readerDisplayName##:
https://doi.org/10.51452/kazatu.2025.3(127).2009Ключевые слова:
вироид веретеновидности клубней картофеля; диагностика; карантинный объект; обратнотранскриптазная полимеразная цепная реакция; праймер; секвенирование.Аннотация
Предпосылки и цель. Вироид веретеновидности клубней картофеля (далее - ВВКК, вироид) представляет собой новый опасный карантинный патоген, способный вызывать значительный ущерб сельскому хозяйству. Актуальной задачей является разработка молекулярной диагностики ВВКК для его раннего выявления. Целью настоящего исследования является оптимизация метода обратнотранскриптазной полимеразной цепной реакции (ОТ-ПЦР) с использованием специфичных праймеров для диагностики ВВКК.
Материалы и методы. Для диагностики ВВКК был проведен подбор праймеров PSTVdfor- XbaI, PSTVd-rev-BamHI, PS88M, PS89P, PS7P, PS7M, Vir1 и Vir2, которые специфичны к вироиду. В статье приводится краткая характеристика ОТ-ПЦР диагностики отечественных и зарубежных образцов ВВКК. Также был изучен температурный градиент отжига праймеров для оптимизации реакции.
Результаты. Применение предложенной схемы ОТ-ПЦР, с использованием подобранных праймеров, показала высокую эффективность при диагностике ВВКК в растительном материале.
Заключение. Оптимизированные протокола ОТ ПЦР с использованием специфичных праймеров может быть успешно применена для ранней диагностики ВВКК в растительном материале.
Результаты исследования имеют важное значение для фитосанитарного мониторинга и контроля качества семенного картофеля в Республике Казахстан.
